Yen’s 最短路径算法
术语表
- 有向
-
有向特征。该算法在有向图上定义良好。
- 有向
-
有向特征。该算法忽略图的方向。
- 有向
-
有向特征。该算法不能在有向图上运行。
- 无向
-
无向特征。该算法在无向图上定义良好。
- 无向
-
无向特征。该算法忽略图的无向性。
- 异构节点
-
异构节点完全支持。该算法有能力区分不同类型的节点。
- 异构节点
-
异构节点允许。该算法平等对待所有选定的节点,无论其标签如何。
- 异构关系
-
异构关系完全支持。该算法有能力区分不同类型的关系。
- 异构关系
-
异构关系允许。该算法平等对待所有选定的关系,无论其类型如何。
- 加权关系
-
加权特征。该算法支持将关系属性用作权重,通过 relationshipWeightProperty 配置参数指定。
- 加权关系
-
加权特征。该算法将每个关系视为同等重要,忽略任何关系权重值。
- 节点属性
-
节点属性特征。该算法使用节点属性。
简介
Yen’s 最短路径算法用于计算两个节点之间的多条最短路径。该算法通常被称为 Yen’s k-最短路径算法,其中 k 是要计算的最短路径的数量。该算法支持具有正权重的加权图。在计算多条最短路径时,它还会考虑同一两个节点之间的平行关系。
当 k = 1 时,该算法的表现与 Dijkstra 最短路径算法 完全一致,返回最短路径。当 k = 2 时,该算法返回同一源节点和目标节点之间的最短路径和次短路径。通常,对于 k = n,该算法最多计算 n 条路径,这些路径按总成本从小到大的顺序被发现。
GDS 的实现基于原始描述。在实际的路径计算中,Yen’s 算法使用了 Dijkstra 最短路径算法。该算法确保不会再次遍历已经发现的最短路径。
该算法的实现是并行化的,但受到源-目标路径中节点数量的限制。如果预期这些路径的长度较短(即只有少量新节点),则不建议设置较高的并发值,因为某些核心可能无法得到利用。
语法
本节介绍了在 Yen’s 算法的每种执行模式下所使用的语法。我们描述的是命名图(named graph)变体语法。要了解更多关于通用语法变体的信息,请参阅 语法概述。
CALL gds.shortestPath.yens.stream(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
index: Integer,
sourceNode: Integer,
targetNode: Integer,
totalCost: Float,
nodeIds: List of Integer,
costs: List of Float,
path: Path
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。具有任何给定标签的节点都将被包含。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。具有任何给定类型的关系都将被包含。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
targetNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 目标节点或节点 ID。 |
k |
整数 |
|
否 |
在源节点和目标节点之间计算的最短路径数量。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
|
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
index |
整数 |
已发现路径的从 0 开始的索引。 |
sourceNode |
整数 |
路径的源节点。 |
targetNode |
整数 |
路径的目标节点。 |
totalCost |
浮点数 |
从源到目标的总成本。 |
nodeIds |
整数列表 |
遍历顺序中路径上的节点 ID。 |
costs |
浮点数列表 |
路径上每个节点的累计成本。 |
path |
路径 |
以 Cypher 实体表示的路径。 |
变异(mutate)模式在投影图中创建新的关系。每种关系代表从源节点到目标节点的一条路径。路径的总成本存储在 totalCost 关系属性中。
CALL gds.shortestPath.yens.mutate(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
relationshipsWritten: Integer,
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
mutateMillis: Integer,
configuration: Map
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
mutateRelationshipType |
字符串 |
|
否 |
用于写入投影图的新关系的关系类型。 |
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
targetNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 目标节点或节点 ID。 |
k |
整数 |
|
是 |
在源节点和目标节点之间计算的最短路径数量。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
预处理图的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
未使用。 |
mutateMillis |
整数 |
向投影图添加关系所需的毫秒数。 |
relationshipsWritten |
整数 |
添加的关系数量。 |
配置 |
Map |
用于运行算法的配置。 |
写入(write)模式在 Neo4j 数据库中创建新的关系。每种关系代表从源节点到目标节点的一条路径。额外的路径信息使用关系属性存储。默认情况下,写入模式存储 totalCost 属性。用户还可以选择存储路径上中间节点的 nodeIds 和 costs。
CALL gds.shortestPath.yens.write(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
relationshipsWritten: Integer,
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
writeMillis: Integer,
configuration: Map
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。具有任何给定标签的节点都将被包含。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。具有任何给定类型的关系都将被包含。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
整数 |
|
是 |
用于将结果写入 Neo4j 的并发线程数。 |
|
writeRelationshipType |
字符串 |
|
否 |
用于将计算出的关系持久化到 Neo4j 数据库的关系类型。 |
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
targetNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 目标节点或节点 ID。 |
k |
整数 |
|
是 |
在源节点和目标节点之间计算的最短路径数量。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
|
writeNodeIds |
布尔值 |
|
是 |
如果为 true,则写入的关系具有 nodeIds 列表属性。 |
writeCosts |
布尔值 |
|
是 |
如果为 true,则写入的关系具有 costs 列表属性。 |
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
预处理图的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
未使用。 |
writeMillis |
整数 |
将关系写入 Neo4j 所需的毫秒数。 |
relationshipsWritten |
整数 |
写入的关系数量。 |
配置 |
Map |
用于运行算法的配置。 |
示例
|
以下所有示例应在空数据库中运行。 这些示例将 Cypher 投影作为规范。原生投影将在未来版本中弃用。 |
在本节中,我们将展示在具体图上运行 Yen’s 算法的示例。目的是说明结果的样子,并为如何在实际环境中使用该算法提供指导。我们将使用一个小型的交通网络图,其中的节点以特定的模式连接。示例图如下所示
CREATE (a:Location {name: 'A'}),
(b:Location {name: 'B'}),
(c:Location {name: 'C'}),
(d:Location {name: 'D'}),
(e:Location {name: 'E'}),
(f:Location {name: 'F'}),
(a)-[:ROAD {cost: 50}]->(b),
(a)-[:ROAD {cost: 50}]->(c),
(a)-[:ROAD {cost: 100}]->(d),
(b)-[:ROAD {cost: 40}]->(d),
(c)-[:ROAD {cost: 40}]->(d),
(c)-[:ROAD {cost: 80}]->(e),
(d)-[:ROAD {cost: 30}]->(e),
(d)-[:ROAD {cost: 80}]->(f),
(e)-[:ROAD {cost: 40}]->(f);
此图构建了一个位置之间有道路的交通网络。像现实世界一样,图中的道路具有不同的长度。这些长度由 cost 关系属性表示。
MATCH (source:Location)-[r:ROAD]->(target:Location)
RETURN gds.graph.project(
'myGraph',
source,
target,
{ relationshipProperties: r { .cost } }
)
在下面的示例中,我们将演示如何使用此图运行 Yen’s 最短路径算法。
内存估算
首先,我们将使用 estimate 过程估算运行算法的成本。这可以在任何执行模式下完成。在这个例子中我们将使用 write 模式。估算算法有助于了解在您的图上运行该算法将产生的内存影响。当您随后在其中一种执行模式下真正运行算法时,系统将执行一次估算。如果估算显示执行超出其内存限制的可能性非常高,则禁止执行。要阅读更多关于此的内容,请参阅 自动估算和执行阻塞。
有关 estimate 的更多详细信息,请参阅 内存估算。
MATCH (source:Location {name: 'A'}), (target:Location {name: 'F'})
CALL gds.shortestPath.yens.write.estimate('myGraph', {
sourceNode: source,
targetNode: target,
k: 3,
relationshipWeightProperty: 'cost',
writeRelationshipType: 'PATH'
})
YIELD nodeCount, relationshipCount, bytesMin, bytesMax, requiredMemory
RETURN nodeCount, relationshipCount, bytesMin, bytesMax, requiredMemory
| nodeCount | relationshipCount | bytesMin | bytesMax | requiredMemory |
|---|---|---|---|---|
6 |
9 |
4664 |
4664 |
"4664 字节" |
流(Stream)模式
在 stream 执行模式下,算法返回每一对源-目标的最短路径。这使我们能够直接检查结果或在 Cypher 中对其进行后处理,而不会产生任何副作用。
有关 stream 模式的更多详细信息,请参阅 流式读取。
MATCH (source:Location {name: 'A'}), (target:Location {name: 'F'})
CALL gds.shortestPath.yens.stream('myGraph', {
sourceNode: source,
targetNode: target,
k: 3,
relationshipWeightProperty: 'cost'
})
YIELD index, sourceNode, targetNode, totalCost, nodeIds, costs, path
RETURN
index,
gds.util.asNode(sourceNode).name AS sourceNodeName,
gds.util.asNode(targetNode).name AS targetNodeName,
totalCost,
[nodeId IN nodeIds | gds.util.asNode(nodeId).name] AS nodeNames,
costs,
nodes(path) as path
ORDER BY index
| index | sourceNodeName | targetNodeName | totalCost | nodeNames | costs | path |
|---|---|---|---|---|---|---|
0 |
"A" |
"F" |
160.0 |
["A", "B", "D", "E", "F"] |
[0.0, 50.0, 90.0, 120.0, 160.0] |
[Node[0], Node[1], Node[3], Node[4], Node[5]] |
1 |
"A" |
"F" |
160.0 |
["A", "C", "D", "E", "F"] |
[0.0, 50.0, 90.0, 120.0, 160.0] |
[Node[0], Node[2], Node[3], Node[4], Node[5]] |
2 |
"A" |
"F" |
170.0 |
["A", "B", "D", "F"] |
[0.0, 50.0, 90.0, 170.0] |
[Node[0], Node[1], Node[3], Node[5]] |
结果显示了节点 A 和节点 F 之间的三条最短路径。前两条路径的总成本相同,但第一条路径通过 B 节点从 A 到达 D,而第二条路径则通过 C 节点。第三条路径的总成本较高,因为它使用成本为 80 的关系直接从 D 到达 F,而前两条路径绕道 E 的成本仅为 70。这一点可以在示例图中验证。Cypher Path 对象可以通过 path 返回字段返回。Path 对象包含节点对象和具有 cost 属性的虚拟关系。
变异(Mutate)模式
mutate 执行模式会使用新关系更新命名图。每条新关系代表从源节点到目标节点的一条路径。关系类型使用 mutateRelationshipType 选项进行配置。路径总成本使用 totalCost 属性存储。
当多个算法结合使用时,mutate 模式特别有用。
有关 mutate 模式的更多详细信息,请参阅 变更。
mutate 模式运行该算法:MATCH (source:Location {name: 'A'}), (target:Location {name: 'F'})
CALL gds.shortestPath.yens.mutate('myGraph', {
sourceNode: source,
targetNode: target,
k: 3,
relationshipWeightProperty: 'cost',
mutateRelationshipType: 'PATH'
})
YIELD relationshipsWritten
RETURN relationshipsWritten
| relationshipsWritten |
|---|
3 |
执行上述查询后,投影图将更新一个类型为 PATH 的新关系。新关系将存储一个单一属性 totalCost。
|
即使输入图是无向的,所产生的关系也始终是有向的。 |
写入(Write)模式
write 执行模式使用新关系更新 Neo4j 数据库。每条新关系代表从源节点到目标节点的一条路径。关系类型使用 writeRelationshipType 选项进行配置。路径总成本使用 totalCost 属性存储。中间节点的 ID 使用 nodeIds 属性存储。到达中间节点的累计成本使用 costs 属性存储。
有关 write 模式的更多详细信息,请参阅 写入。
write 模式运行该算法:MATCH (source:Location {name: 'A'}), (target:Location {name: 'F'})
CALL gds.shortestPath.yens.write('myGraph', {
sourceNode: source,
targetNode: target,
k: 3,
relationshipWeightProperty: 'cost',
writeRelationshipType: 'PATH',
writeNodeIds: true,
writeCosts: true
})
YIELD relationshipsWritten
RETURN relationshipsWritten
| relationshipsWritten |
|---|
3 |
上述查询将写回一个类型为 PATH 的关系到 Neo4j。该关系存储了描述路径的三个属性:totalCost、nodeIds 和 costs。
|
即使输入图是无向的,所写入的关系也始终是有向的。 |
图修剪优化
在无向图和具有反向索引的图上,GDS 在预处理步骤中应用了图修剪优化,正如 PeeK: A Prune-Centric Approach for K Shortest Path Computation 中所述。
这使得 Yen’s 算法可以在较小的图上运行,在大多数情况下,这会带来显著的性能提升。特别是对于较大的 k 值。
图修剪默认应用于无向图。
为了在有向图上应用,必须在关系投影中使用 indexInverse 参数。反向索引允许算法根据相反的方向遍历节点的各种关系。
MATCH (source:Location)-[r:ROAD]->(target:Location)
RETURN gds.graph.project(
'myIndexedGraph',
source,
target,
{ relationshipProperties: r { .cost } },
{ inverseIndexedRelationshipTypes: ['*'] }
)
以下查询与流示例相同。这一次,我们在 myIndexedGraph 上执行 Yen’s 算法,这将允许使用 Peek 修剪。
MATCH (source:Location {name: 'A'}), (target:Location {name: 'F'})
CALL gds.shortestPath.yens.stream('myIndexedGraph', {
sourceNode: source,
targetNode: target,
k: 3,
relationshipWeightProperty: 'cost'
})
YIELD index, sourceNode, targetNode, totalCost, nodeIds, costs, path
RETURN
index,
gds.util.asNode(sourceNode).name AS sourceNodeName,
gds.util.asNode(targetNode).name AS targetNodeName,
totalCost,
[nodeId IN nodeIds | gds.util.asNode(nodeId).name] AS nodeNames,
costs,
nodes(path) as path
ORDER BY index
| index | sourceNodeName | targetNodeName | totalCost | nodeNames | costs | path |
|---|---|---|---|---|---|---|
0 |
"A" |
"F" |
160.0 |
["A", "B", "D", "E", "F"] |
[0.0, 50.0, 90.0, 120.0, 160.0] |
[Node[0], Node[1], Node[3], Node[4], Node[5]] |
1 |
"A" |
"F" |
160.0 |
["A", "C", "D", "E", "F"] |
[0.0, 50.0, 90.0, 120.0, 160.0] |
[Node[0], Node[2], Node[3], Node[4], Node[5]] |
2 |
"A" |
"F" |
170.0 |
["A", "B", "D", "F"] |
[0.0, 50.0, 90.0, 170.0] |
[Node[0], Node[1], Node[3], Node[5]] |