节点相似度 (Node Similarity)
本节介绍了 Neo4j 图数据科学库中的节点相似度算法。该算法基于 Jaccard 和重叠 (Overlap) 相似度指标。
术语表
- 有向
-
有向特征。该算法在有向图上定义良好。
- 有向
-
有向特征。该算法忽略图的方向。
- 有向
-
有向特征。该算法不能在有向图上运行。
- 无向
-
无向特征。该算法在无向图上定义良好。
- 无向
-
无向特征。该算法忽略图的无向性。
- 异构节点
-
异构节点完全支持。该算法有能力区分不同类型的节点。
- 异构节点
-
异构节点允许。该算法平等对待所有选定的节点,无论其标签如何。
- 异构关系
-
异构关系完全支持。该算法有能力区分不同类型的关系。
- 异构关系
-
异构关系允许。该算法平等对待所有选定的关系,无论其类型如何。
- 加权关系
-
加权特征。该算法支持将关系属性用作权重,通过 relationshipWeightProperty 配置参数指定。
- 加权关系
-
加权特征。该算法将每个关系视为同等重要,忽略任何关系权重值。
- 节点属性
-
节点属性特征。该算法使用节点属性。
简介
节点相似度算法基于节点所连接的其他节点来比较一组节点。如果两个节点共享许多相同的邻居,则认为它们是相似的。节点相似度基于 Jaccard 指标(也称为 Jaccard 相似度得分)、重叠系数(也称为 Szymkiewicz–Simpson 系数)以及余弦相似度得分来计算成对相似度。前两者最常用于无权集合,而余弦相似度通常用于加权输入。
给定两个集合 A 和 B,Jaccard 相似度使用以下公式计算
重叠系数使用以下公式计算
加权情况的公式可在下方的加权示例中找到。
余弦相似度得分使用以下公式计算,其中当 A 和 B 为无权时,条目的权重默认为 1
该算法的输入是一个包含两个不相交节点集的二分连通图。每条关系都始于第一个节点集中的一个节点,并终止于第二个节点集中的一个节点。
节点相似度算法会将每个具有出度的节点与其他此类节点进行比较。对于每个节点 n,我们收集该节点的出邻居 N(n),即所有满足存在从 n 到 m 的关系的节点 m。对于每一对 n, m,算法会计算该对的相似度,结果等于所选相似度指标在 N(n) 和 N(m) 上的计算结果。
节点相似度的时间复杂度为 O(n3),空间复杂度为 O(n2)。我们以 O(n2) 的时间和空间计算并存储邻居集,然后以 O(n3) 的时间计算成对相似度得分。
为了限制内存使用,您可以为每个节点指定输出结果数量的明确上限,即 'topK' 参数。它可以设置为除 0 以外的任何值。当然,您会在整体计算中损失精度,而运行时间不受影响——我们仍然必须在丢弃结果之前计算出它们。
该算法的输出是第一个节点集各对节点之间的新关系。相似度得分通过关系属性表示。
有关此算法的更多信息,请参阅
也可以对生成的相似度对中的源节点和/或目标节点进行过滤。为此,您可以参考过滤后的节点相似度算法。
|
运行此算法需要足够的可用内存。在运行此算法之前,我们建议您阅读内存估算。 |
语法
本节涵盖了执行节点相似度算法各种模式时使用的语法。我们描述的是命名图变体的语法。要了解更多关于通用语法变体的信息,请参阅语法概述。
CALL gds.nodeSimilarity.stream(
graphName: String,
configuration: Map
) YIELD
node1: Integer,
node2: Integer,
similarity: Float
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。具有任何给定标签的节点都将被包含。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。具有任何给定类型的关系都将被包含。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
similarityCutoff |
浮点数 |
|
是 |
结果中显示相似度得分的下限。值必须介于 0 和 1 之间。 |
degreeCutoff |
整数 |
|
是 |
节点被纳入比较所需满足的节点度数的包含性下限。该值不能低于 1。 |
upperDegreeCutoff |
整数 |
|
是 |
节点被纳入比较所需满足的节点度数的包含性上限。该值不能低于 1。 |
topK |
整数 |
|
是 |
每个节点的得分数量上限。返回 K 个最大的结果。此值不能低于 1。 |
bottomK |
整数 |
|
是 |
每个节点的得分数量上限。返回 K 个最小的结果。此值不能低于 1。 |
topN |
整数 |
|
是 |
计算出的得分的全局总数上限。返回 N 个最大的结果。此值不能为负数,值为 0 表示没有全局上限。 |
bottomN |
整数 |
|
是 |
计算出的得分的全局总数上限。返回 N 个最小的结果。此值不能为负数,值为 0 表示没有全局上限。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
|
similarityMetric |
字符串 |
|
是 |
用于计算相似度的指标。可以是 |
useComponents |
布尔值或字符串 |
|
是 |
如果启用,节点相似度将使用组件来提高计算性能,跳过不同组件中节点之间的比较。设置为 |
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
|
整数 |
第一个节点的节点 ID。 |
|
整数 |
第二个节点的节点 ID。 |
|
浮点数 |
两个节点的相似度分数。 |
CALL gds.nodeSimilarity.stats(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
nodesCompared: Integer,
similarityPairs: Integer,
similarityDistribution: Map,
configuration: Map
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。具有任何给定标签的节点都将被包含。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。具有任何给定类型的关系都将被包含。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
similarityCutoff |
浮点数 |
|
是 |
结果中显示相似度得分的下限。值必须介于 0 和 1 之间。 |
degreeCutoff |
整数 |
|
是 |
节点被纳入比较所需满足的节点度数的包含性下限。该值不能低于 1。 |
upperDegreeCutoff |
整数 |
|
是 |
节点被纳入比较所需满足的节点度数的包含性上限。该值不能低于 1。 |
topK |
整数 |
|
是 |
每个节点的得分数量上限。返回 K 个最大的结果。此值不能低于 1。 |
bottomK |
整数 |
|
是 |
每个节点的得分数量上限。返回 K 个最小的结果。此值不能低于 1。 |
topN |
整数 |
|
是 |
计算出的得分的全局总数上限。返回 N 个最大的结果。此值不能为负数,值为 0 表示没有全局上限。 |
bottomN |
整数 |
|
是 |
计算出的得分的全局总数上限。返回 N 个最小的结果。此值不能为负数,值为 0 表示没有全局上限。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
|
similarityMetric |
字符串 |
|
是 |
用于计算相似度的指标。可以是 |
useComponents |
布尔值或字符串 |
|
是 |
如果启用,节点相似度将使用组件来提高计算性能,跳过不同组件中节点之间的比较。设置为 |
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
预处理数据的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
计算组件计数和分布统计信息的毫秒数。 |
nodesCompared |
整数 |
计算过相似度的节点数量。 |
similarityPairs |
整数 |
结果中的相似度对数量。 |
similarityDistribution |
Map |
包含计算出的相似度结果的最小值、最大值、平均值以及 p50, p75, p90, p95, p99 和 p999 百分位值的映射。 |
配置 |
Map |
用于运行算法的配置。 |
CALL gds.nodeSimilarity.mutate(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
mutateMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
relationshipsWritten: Integer,
nodesCompared: Integer,
similarityDistribution: Map,
configuration: Map
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
mutateRelationshipType |
字符串 |
|
否 |
用于写入投影图的新关系的关系类型。 |
mutateProperty |
字符串 |
|
否 |
GDS 图中写入相似度分数的属性。 |
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
similarityCutoff |
浮点数 |
|
是 |
结果中显示相似度得分的下限。值必须介于 0 和 1 之间。 |
degreeCutoff |
整数 |
|
是 |
节点被纳入比较所需满足的节点度数的包含性下限。该值不能低于 1。 |
upperDegreeCutoff |
整数 |
|
是 |
节点被纳入比较所需满足的节点度数的包含性上限。该值不能低于 1。 |
topK |
整数 |
|
是 |
每个节点的得分数量上限。返回 K 个最大的结果。此值不能低于 1。 |
bottomK |
整数 |
|
是 |
每个节点的得分数量上限。返回 K 个最小的结果。此值不能低于 1。 |
topN |
整数 |
|
是 |
计算出的得分的全局总数上限。返回 N 个最大的结果。此值不能为负数,值为 0 表示没有全局上限。 |
bottomN |
整数 |
|
是 |
计算出的得分的全局总数上限。返回 N 个最小的结果。此值不能为负数,值为 0 表示没有全局上限。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
|
similarityMetric |
字符串 |
|
是 |
用于计算相似度的指标。可以是 |
useComponents |
布尔值或字符串 |
|
是 |
如果启用,节点相似度将使用组件来提高计算性能,跳过不同组件中节点之间的比较。设置为 |
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
预处理数据的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
mutateMillis |
整数 |
向投影图添加属性的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
计算百分位数的毫秒数。 |
nodesCompared |
整数 |
计算过相似度的节点数量。 |
relationshipsWritten |
整数 |
创建的关系数量。 |
similarityDistribution |
Map |
包含计算出的相似度结果的最小值、最大值、平均值、标准差以及 p1, p5, p10, p25, p75, p90, p95, p99, p100 百分位值的映射。 |
配置 |
Map |
用于运行算法的配置。 |
CALL gds.nodeSimilarity.write(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
writeMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
nodesCompared: Integer,
relationshipsWritten: Integer,
similarityDistribution: Map,
configuration: Map
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。具有任何给定标签的节点都将被包含。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。具有任何给定类型的关系都将被包含。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
整数 |
|
是 |
用于将结果写入 Neo4j 的并发线程数。 |
|
writeRelationshipType |
字符串 |
|
否 |
用于将计算出的关系持久化到 Neo4j 数据库的关系类型。 |
字符串 |
|
否 |
Neo4j 数据库中写入相似度分数的属性。 |
|
similarityCutoff |
浮点数 |
|
是 |
结果中显示相似度得分的下限。值必须介于 0 和 1 之间。 |
degreeCutoff |
整数 |
|
是 |
节点被纳入比较所需满足的节点度数的包含性下限。该值不能低于 1。 |
upperDegreeCutoff |
整数 |
|
是 |
节点被纳入比较所需满足的节点度数的包含性上限。该值不能低于 1。 |
topK |
整数 |
|
是 |
每个节点的得分数量上限。返回 K 个最大的结果。此值不能低于 1。 |
bottomK |
整数 |
|
是 |
每个节点的得分数量上限。返回 K 个最小的结果。此值不能低于 1。 |
topN |
整数 |
|
是 |
计算出的得分的全局总数上限。返回 N 个最大的结果。此值不能为负数,值为 0 表示没有全局上限。 |
bottomN |
整数 |
|
是 |
计算出的得分的全局总数上限。返回 N 个最小的结果。此值不能为负数,值为 0 表示没有全局上限。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
|
similarityMetric |
字符串 |
|
是 |
用于计算相似度的指标。可以是 |
useComponents |
布尔值或字符串 |
|
是 |
如果启用,节点相似度将使用组件来提高计算性能,跳过不同组件中节点之间的比较。设置为 |
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
预处理数据的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
writeMillis |
整数 |
将结果数据写回 Neo4j 的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
计算百分位数的毫秒数。 |
nodesCompared |
整数 |
计算过相似度的节点数量。 |
relationshipsWritten |
整数 |
创建的关系数量。 |
similarityDistribution |
Map |
包含计算出的相似度结果的最小值、最大值、平均值、标准差以及 p1, p5, p10, p25, p75, p90, p95, p99, p100 百分位值的映射。 |
配置 |
Map |
用于运行算法的配置。 |
示例
|
以下所有示例应在空数据库中运行。 这些示例将 Cypher 投影作为规范。原生投影将在未来版本中弃用。 |
在本节中,我们将展示在具体图上运行节点相似度算法的示例。目的是说明结果的样子,并为如何在实际环境中使用该算法提供指南。我们将使用一个小型知识图谱,其中包含少量以特定模式连接的节点。示例图如下所示
CREATE
(alice:Person {name: 'Alice'}),
(bob:Person {name: 'Bob'}),
(carol:Person {name: 'Carol'}),
(dave:Person {name: 'Dave'}),
(eve:Person {name: 'Eve'}),
(guitar:Instrument {name: 'Guitar'}),
(synth:Instrument {name: 'Synthesizer'}),
(bongos:Instrument {name: 'Bongos'}),
(trumpet:Instrument {name: 'Trumpet'}),
(alice)-[:LIKES]->(guitar),
(alice)-[:LIKES]->(synth),
(alice)-[:LIKES {strength: 0.5}]->(bongos),
(bob)-[:LIKES]->(guitar),
(bob)-[:LIKES]->(synth),
(carol)-[:LIKES]->(bongos),
(dave)-[:LIKES]->(guitar),
(dave)-[:LIKES {strength: 1.5}]->(trumpet),
(dave)-[:LIKES]->(bongos);
这个二分图有两个节点集:人 (Person) 节点和乐器 (Instrument) 节点。这两个节点集通过 LIKES 关系连接。每条关系都始于一个 Person 节点,并终止于一个 Instrument 节点。
在示例中,我们希望使用节点相似度算法根据人们喜欢的乐器来比较他们。
节点相似度算法仅计算度数至少为 1 的节点的相似度。在示例图中,Eve 节点将不会与其他 Person 节点进行比较。
MATCH (source:Person)
OPTIONAL MATCH (source)-[r:LIKES]->(target:Instrument)
RETURN gds.graph.project(
'myGraph',
source,
target,
{ relationshipProperties: r { strength: coalesce(r.strength, 1.0) } }
)
在接下来的示例中,我们将演示如何在图上使用节点相似度算法。
内存估算
首先,我们将使用 estimate 过程估算运行算法的成本。这可以在任何执行模式下完成。在这个例子中我们将使用 write 模式。估算算法有助于了解在您的图上运行该算法将产生的内存影响。当您随后在其中一种执行模式下真正运行算法时,系统将执行一次估算。如果估算显示执行超出其内存限制的可能性非常高,则禁止执行。要阅读更多关于此的内容,请参阅 自动估算和执行阻塞。
有关 estimate 的更多详细信息,请参阅 内存估算。
CALL gds.nodeSimilarity.write.estimate('myGraph', {
writeRelationshipType: 'SIMILAR',
writeProperty: 'score'
})
YIELD nodeCount, relationshipCount, bytesMin, bytesMax, requiredMemory
| nodeCount | relationshipCount | bytesMin | bytesMax | requiredMemory |
|---|---|---|---|---|
9 |
9 |
2384 |
2600 |
"[2384 字节 ... 2600 字节]" |
流 (Stream)
在 stream 执行模式下,算法返回每个关系的相似度分数。这允许我们直接检查结果或在 Cypher 中进行后处理,而不会产生任何副作用。
有关 stream 模式的更多详细信息,请参阅 流式读取。
CALL gds.nodeSimilarity.stream('myGraph')
YIELD node1, node2, similarity
RETURN gds.util.asNode(node1).name AS Person1, gds.util.asNode(node2).name AS Person2, similarity
ORDER BY similarity DESCENDING, Person1, Person2
| Person1 | Person2 | similarity |
|---|---|---|
"Alice" |
"Bob" |
0.6666666666666666 |
"Bob" |
"Alice" |
0.6666666666666666 |
"Alice" |
"Dave" |
0.5 |
"Dave" |
"Alice" |
0.5 |
"Alice" |
"Carol" |
0.3333333333333333 |
"Carol" |
"Alice" |
0.3333333333333333 |
"Carol" |
"Dave" |
0.3333333333333333 |
"Dave" |
"Carol" |
0.3333333333333333 |
"Bob" |
"Dave" |
0.25 |
"Dave" |
"Bob" |
0.25 |
我们对过程配置参数使用默认值。topK 设置为 10,topN 设置为 0。因此,结果集包含每个节点的前 10 个相似度得分。
|
如果我们想改为比较乐器之间的相似性,我们将使用 |
统计 (Stats)
在 stats 执行模式下,算法返回一行包含算法结果摘要的数据。此执行模式没有任何副作用。通过检查 computeMillis 返回项来评估算法性能非常有用。在下面的示例中,我们将省略返回的时间。该过程的完整签名可以在语法部分找到。
有关 stats 模式的更多详细信息,请参阅 统计。
CALL gds.nodeSimilarity.stats('myGraph')
YIELD nodesCompared, similarityPairs
| nodesCompared | similarityPairs |
|---|---|
4 |
10 |
变更 (Mutate)
mutate 执行模式扩展了 stats 模式并产生了一个重要的副作用:使用包含该关系相似度分数的新关系属性更新命名图。新属性的名称使用强制配置参数 mutateProperty 指定。结果是一个摘要行,类似于 stats,但包含一些额外的指标。mutate 模式在同时使用多个算法时特别有用。
有关 mutate 模式的更多详细信息,请参阅 变更。
CALL gds.nodeSimilarity.mutate('myGraph', {
mutateRelationshipType: 'SIMILAR',
mutateProperty: 'score'
})
YIELD nodesCompared, relationshipsWritten
| nodesCompared | relationshipsWritten |
|---|---|
4 |
10 |
从结果中可以看出,创建的关系数量等于流式示例中的行数。
|
由变更产生的所有关系都是有向的,即使输入图是无向的。如果 |
写入 (Write)
write 执行模式会为每一对节点在 Neo4j 数据库中创建一个关系,并将相似度得分作为该关系的属性。新关系的类型使用强制配置参数 writeRelationshipType 指定。新属性的名称使用强制配置参数 writeProperty 指定。结果是一行摘要,类似于 stats,但包含一些额外的指标。
有关 write 模式的更多详细信息,请参阅 写入。
CALL gds.nodeSimilarity.write('myGraph', {
writeRelationshipType: 'SIMILAR',
writeProperty: 'score'
})
YIELD nodesCompared, relationshipsWritten
| nodesCompared | relationshipsWritten |
|---|---|
4 |
10 |
从结果中可以看出,创建的关系数量等于流式示例中的行数。
|
写入的关系始终是有向的,即使输入图是无向的。如果 |
限制结果
可以对相似度结果应用四种限制。Top 将结果限制为最高相似度得分。Bottom 将结果限制为最低相似度得分。Top 和 bottom 限制都可以应用于整个结果集 ("N"),或应用于每个节点的结果 ("K")。
|
始终必须有一个 "K" 限制(bottomK 或 topK),它必须是一个正数。topK 和 bottomK 的默认值为 10。 |
| 总结果数 | 每个节点的结果数 | |
|---|---|---|
最高分 |
topN |
topK |
最低分 |
bottomN |
bottomK |
topK 和 bottomK
TopK 和 bottomK 是每个节点计算得分数量的限制。对于 topK,返回每个节点的前 K 个最大相似度得分。对于 bottomK,返回每个节点的后 K 个最小相似度得分。TopK 和 bottomK 不能为 0,不能同时使用,默认值为 10。如果未指定,则使用 topK。
CALL gds.nodeSimilarity.stream('myGraph', { topK: 1 })
YIELD node1, node2, similarity
RETURN gds.util.asNode(node1).name AS Person1, gds.util.asNode(node2).name AS Person2, similarity
ORDER BY Person1
| Person1 | Person2 | similarity |
|---|---|---|
"Alice" |
"Bob" |
0.666666666666667 |
"Bob" |
"Alice" |
0.666666666666667 |
"Carol" |
"Alice" |
0.333333333333333 |
"Dave" |
"Alice" |
0.5 |
CALL gds.nodeSimilarity.stream('myGraph', { bottomK: 1 })
YIELD node1, node2, similarity
RETURN gds.util.asNode(node1).name AS Person1, gds.util.asNode(node2).name AS Person2, similarity
ORDER BY Person1
| Person1 | Person2 | similarity |
|---|---|---|
"Alice" |
"Carol" |
0.3333333333333333 |
"Bob" |
"Dave" |
0.25 |
"Carol" |
"Alice" |
0.3333333333333333 |
"Dave" |
"Bob" |
0.25 |
topN 和 bottomN
TopN 和 bottomN 限制所有节点上的相似度得分数量。这是对总结果集的限制,是对每个节点 topK 或 bottomK 限制的补充。对于 topN,返回前 N 个最大相似度得分。对于 bottomN,返回后 N 个最小相似度得分。值为 0 表示不施加全局限制,返回所有来自 topK 或 bottomK 的结果。
CALL gds.nodeSimilarity.stream('myGraph', { topK: 1, topN: 3 })
YIELD node1, node2, similarity
RETURN gds.util.asNode(node1).name AS Person1, gds.util.asNode(node2).name AS Person2, similarity
ORDER BY similarity DESC, Person1, Person2
| Person1 | Person2 | similarity |
|---|---|---|
"Alice" |
"Bob" |
0.6666666667 |
"Bob" |
"Alice" |
0.6666666667 |
"Dave" |
"Alice" |
0.5 |
度数截断和相似度截断
可以通过两个名为 degreeCutoff 和 upperDegreeCutoff 的整数参数来调整节点相似度,从而根据度数约束忽略某些节点。如果设置,degreeCutoff 会对参与比较的节点度数设置下限,并跳过任何度数低于 degreeCutoff 的节点。如果设置,upperDegreeCutoff 会对节点度数设置上限,并跳过任何度数高于 upperDegreeCutoff 的节点。这两个参数也可以组合使用,以便只考虑度数落入特定区间的节点。
两个参数的最小值均为 1。
CALL gds.nodeSimilarity.stream('myGraph', { degreeCutoff: 3 })
YIELD node1, node2, similarity
RETURN gds.util.asNode(node1).name AS Person1, gds.util.asNode(node2).name AS Person2, similarity
ORDER BY Person1
| Person1 | Person2 | similarity |
|---|---|---|
"Alice" |
"Dave" |
0.5 |
"Dave" |
"Alice" |
0.5 |
相似度截断是结果中出现相似度得分的下限。默认值非常小 (1E-42),用于排除相似度得分为 0 的结果。
|
将相似度截断设置为 0 可能会产生非常大的结果集,增加运行时间和内存消耗。 |
CALL gds.nodeSimilarity.stream('myGraph', { similarityCutoff: 0.5 })
YIELD node1, node2, similarity
RETURN gds.util.asNode(node1).name AS Person1, gds.util.asNode(node2).name AS Person2, similarity
ORDER BY Person1
| Person1 | Person2 | similarity |
|---|---|---|
"Alice" |
"Bob" |
0.666666666666667 |
"Alice" |
"Dave" |
0.5 |
"Bob" |
"Alice" |
0.6666666666666666 |
"Dave" |
"Alice" |
0.5 |
加权相似度
关系属性可用于通过将其值作为衡量重要性的方式,来修改由特定关系引起的相似度。默认情况下,加权节点相似度根据以下公式使用加权 Jaccard 相似度
形式上,给定两个节点及其加权邻居列表 A' 和 B',我们将列表扩展为 A 和 B,对它们的邻居并集 A' ∪ B' 进行索引(对于任何非邻居设置权重 = 0),然后应用加权 Jaccard 相似度。
它还支持加权重叠 (Overlap) 相似度,根据以下公式
此外,如简介所述,加权情况下也可以使用余弦相似度。
|
加权相似度指标仅针对大于或等于 0 的值定义。 |
CALL gds.nodeSimilarity.stream('myGraph', { relationshipWeightProperty: 'strength', similarityCutoff: 0.3 })
YIELD node1, node2, similarity
RETURN gds.util.asNode(node1).name AS Person1, gds.util.asNode(node2).name AS Person2, similarity
ORDER BY Person1
| Person1 | Person2 | similarity |
|---|---|---|
"Alice" |
"Bob" |
0.8 |
"Alice" |
"Dave" |
0.333333333333333 |
"Bob" |
"Alice" |
0.8 |
"Dave" |
"Alice" |
0.333333333333333 |
可以看出,与该算法的非加权版本相比,Alice 和 Dave 之间的相似度降低了(从 0.5 降至 0.33)。
Alice 喜欢 Guitar、Synthesizer 和 Bongos,强度分别为 (1, 1, 0.5)。Dave 喜欢 Guitar、Bongos 和 Trumpet,强度分别为 (1, 1, 1.5)。因此,取 Alice 和 Dave 的邻居,Alice 的强度列表为 A = (1, 1, 0.5, 0),Dave 的为 B = (1, 0, 1, 1.5),索引为 Guitar, Synthesizer, Bongos, Trumpet。
因此,Alice 和 Dave 的加权(Jaccard)节点相似度为
类似地,Alice 和 Bob 之间的相似度增加了(从 0.66 增加到 0.8),因为缺失的喜欢乐器对相似度得分的影响较低。