Delta-Stepping 单源最短路径
术语表
- 有向
-
有向特征。该算法在有向图上定义良好。
- 有向
-
有向特征。该算法忽略图的方向。
- 有向
-
有向特征。该算法不能在有向图上运行。
- 无向
-
无向特征。该算法在无向图上定义良好。
- 无向
-
无向特征。该算法忽略图的无向性。
- 异构节点
-
异构节点完全支持。该算法有能力区分不同类型的节点。
- 异构节点
-
异构节点允许。该算法平等对待所有选定的节点,无论其标签如何。
- 异构关系
-
异构关系完全支持。该算法有能力区分不同类型的关系。
- 异构关系
-
异构关系允许。该算法平等对待所有选定的关系,无论其类型如何。
- 加权关系
-
加权特征。该算法支持将关系属性用作权重,通过 relationshipWeightProperty 配置参数指定。
- 加权关系
-
加权特征。该算法将每个关系视为同等重要,忽略任何关系权重值。
- 节点属性
-
节点属性特征。该算法使用节点属性。
介绍
Delta-Stepping 最短路径算法用于计算图中源节点到所有可达节点之间的最短路径。该算法支持具有正权重的加权图。若要计算源节点与单个目标节点之间的最短路径,可以使用 Dijkstra 源-目标最短路径。
与 Dijkstra 单源最短路径 相比,Delta-Stepping 算法是一种距离修正算法。这一特性使其能够并行遍历图。该算法保证始终能找到源节点与目标节点之间的最短路径。然而,如果两个节点之间存在多条最短路径,则不保证每次计算都返回同一条路径。
GDS 的实现基于 [1],并融合了 [2] 中讨论的桶融合(bucket fusion)优化。算法执行时使用在过程配置中定义的多个线程。
有关此算法的更多信息,请参阅
语法
本节涵盖执行 Delta-Stepping 算法在各模式下所需的语法。此处描述的是命名图(named graph)的语法变体。如需了解通用语法变体,请参阅 语法概述。
CALL gds.allShortestPaths.delta.stream(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
index: Integer,
sourceNode: Integer,
targetNode: Integer,
totalCost: Float,
nodeIds: List of Integer,
costs: List of Float,
path: Path
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。具有任何给定标签的节点都将被包含。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。具有任何给定类型的关系都将被包含。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
delta |
浮点数 |
|
是 |
用于对到源节点具有相同暂定距离的节点进行分组的桶宽度。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
|
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
index |
整数 |
已发现路径的从 0 开始的索引。 |
sourceNode |
整数 |
路径的源节点。 |
targetNode |
整数 |
路径的目标节点。 |
totalCost |
浮点数 |
从源到目标的总成本。 |
nodeIds |
整数列表 |
遍历顺序中路径上的节点 ID。 |
costs |
浮点数列表 |
路径上每个节点的累计成本。 |
path |
路径 |
以 Cypher 实体表示的路径。 |
变异(mutate)模式在投影图中创建新的关系。每种关系代表从源节点到目标节点的一条路径。路径的总成本存储在 totalCost 关系属性中。
CALL gds.allShortestPaths.delta.mutate(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
relationshipsWritten: Integer,
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
mutateMillis: Integer,
configuration: Map
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
mutateRelationshipType |
字符串 |
|
否 |
用于写入投影图的新关系的关系类型。 |
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
delta |
浮点数 |
|
是 |
用于对到源节点具有相同暂定距离的节点进行分组的桶宽度。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
预处理图的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
未使用。 |
mutateMillis |
整数 |
向投影图添加关系所需的毫秒数。 |
relationshipsWritten |
整数 |
添加的关系数量。 |
配置 |
Map |
用于运行算法的配置。 |
写入(write)模式在 Neo4j 数据库中创建新的关系。每种关系代表从源节点到目标节点的一条路径。额外的路径信息使用关系属性存储。默认情况下,写入模式存储 totalCost 属性。用户还可以选择存储路径上中间节点的 nodeIds 和 costs。
CALL gds.allShortestPaths.delta.write(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
relationshipsWritten: Integer,
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
writeMillis: Integer,
configuration: Map
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。具有任何给定标签的节点都将被包含。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。具有任何给定类型的关系都将被包含。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
整数 |
|
是 |
用于将结果写入 Neo4j 的并发线程数。 |
|
writeRelationshipType |
字符串 |
|
否 |
用于将计算出的关系持久化到 Neo4j 数据库的关系类型。 |
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
delta |
浮点数 |
|
是 |
用于对到源节点具有相同暂定距离的节点进行分组的桶宽度。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
|
writeNodeIds |
布尔值 |
|
是 |
如果为 true,则写入的关系具有 nodeIds 列表属性。 |
writeCosts |
布尔值 |
|
是 |
如果为 true,则写入的关系具有 costs 列表属性。 |
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
预处理图的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
未使用。 |
writeMillis |
整数 |
将关系写入 Neo4j 所需的毫秒数。 |
relationshipsWritten |
整数 |
写入的关系数量。 |
配置 |
Map |
用于运行算法的配置。 |
CALL gds.allShortestPaths.delta.stats(
graphName: String,
configuration: Map
)
YIELD
preProcessingMillis: Integer,
computeMillis: Integer,
postProcessingMillis: Integer,
configuration: Map
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
graphName |
字符串 |
|
否 |
存储在目录中的图的名称。 |
配置 |
Map |
|
是 |
算法特定配置和/或图过滤配置。 |
| 名称 | 类型 | 默认 | 可选 | 描述 |
|---|---|---|---|---|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的节点标签过滤命名图。具有任何给定标签的节点都将被包含。 |
|
字符串列表 |
|
是 |
使用给定的关系类型过滤命名图。具有任何给定类型的关系都将被包含。 |
|
整数 |
|
是 |
用于运行算法的并发线程数。 |
|
字符串 |
|
是 |
可以提供一个 ID 以更轻松地跟踪算法的进度。 |
|
布尔值 |
|
是 |
如果禁用,进度百分比将不会被记录。 |
|
sourceNode |
整数 |
|
否 |
Neo4j 源节点或节点 ID。 |
delta |
浮点数 |
|
是 |
用于对到源节点具有相同暂定距离的节点进行分组的桶宽度。 |
字符串 |
|
是 |
用作权重的关系属性名称。如果未指定,算法将作为无权重运行。 |
|
| 名称 | 类型 | 描述 |
|---|---|---|
preProcessingMillis |
整数 |
预处理图的毫秒数。 |
computeMillis |
整数 |
运行算法的毫秒数。 |
postProcessingMillis |
整数 |
未使用。 |
配置 |
Map |
用于运行算法的配置。 |
示例
|
以下所有示例应在空数据库中运行。 这些示例将 Cypher 投影作为规范。原生投影将在未来版本中弃用。 |
在本节中,我们将展示在具体图上运行 Delta-Stepping 算法的示例。目的是说明结果的形式,并提供在实际场景中使用该算法的指南。我们将使用一个小型交通网络图,该图由少量以特定模式连接的节点组成。示例图如下所示:
CREATE (a:Location {name: 'A'}),
(b:Location {name: 'B'}),
(c:Location {name: 'C'}),
(d:Location {name: 'D'}),
(e:Location {name: 'E'}),
(f:Location {name: 'F'}),
(a)-[:ROAD {cost: 50}]->(b),
(a)-[:ROAD {cost: 50}]->(c),
(a)-[:ROAD {cost: 100}]->(d),
(b)-[:ROAD {cost: 40}]->(d),
(c)-[:ROAD {cost: 40}]->(d),
(c)-[:ROAD {cost: 80}]->(e),
(d)-[:ROAD {cost: 30}]->(e),
(d)-[:ROAD {cost: 80}]->(f),
(e)-[:ROAD {cost: 40}]->(f);
此图构建了一个位置之间有道路的交通网络。像现实世界一样,图中的道路具有不同的长度。这些长度由 cost 关系属性表示。
MATCH (source:Location)-[r:ROAD]->(target:Location)
RETURN gds.graph.project(
'myGraph',
source,
target,
{ relationshipProperties: r { .cost } }
)
在接下来的示例中,我们将演示如何使用此图来运行 Delta-Stepping 最短路径算法。
内存估算
首先,我们将使用 estimate 过程估算运行算法的成本。这可以在任何执行模式下完成。在这个例子中我们将使用 write 模式。估算算法有助于了解在您的图上运行该算法将产生的内存影响。当您随后在其中一种执行模式下真正运行算法时,系统将执行一次估算。如果估算显示执行超出其内存限制的可能性非常高,则禁止执行。要阅读更多关于此的内容,请参阅 自动估算和执行阻塞。
有关 estimate 的更多详细信息,请参阅 内存估算。
MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.delta.write.estimate('myGraph', {
sourceNode: source,
relationshipWeightProperty: 'cost',
writeRelationshipType: 'PATH'
})
YIELD nodeCount, relationshipCount, bytesMin, bytesMax, requiredMemory
RETURN nodeCount, relationshipCount, bytesMin, bytesMax, requiredMemory
| nodeCount | relationshipCount | bytesMin | bytesMax | requiredMemory |
|---|---|---|---|---|
6 |
9 |
368 |
576 |
"[368 Bytes ... 576 Bytes]" |
流(Stream)模式
在 stream 执行模式下,算法返回每一对源-目标的最短路径。这使我们能够直接检查结果或在 Cypher 中对其进行后处理,而不会产生任何副作用。
有关 stream 模式的更多详细信息,请参阅 流式读取。
MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.delta.stream('myGraph', {
sourceNode: source,
relationshipWeightProperty: 'cost',
delta: 3.0
})
YIELD index, sourceNode, targetNode, totalCost, nodeIds, costs, path
RETURN
index,
gds.util.asNode(sourceNode).name AS sourceNodeName,
gds.util.asNode(targetNode).name AS targetNodeName,
totalCost,
[nodeId IN nodeIds | gds.util.asNode(nodeId).name] AS nodeNames,
costs,
nodes(path) as path
ORDER BY index
| index | sourceNodeName | targetNodeName | totalCost | nodeNames | costs | path |
|---|---|---|---|---|---|---|
0 |
"A" |
"A" |
0.0 |
["A"] |
[0.0] |
[Node[0]] |
1 |
"A" |
"B" |
50.0 |
["A", "B"] |
[0.0, 50.0] |
[Node[0], Node[1]] |
2 |
"A" |
"C" |
50.0 |
["A", "C"] |
[0.0, 50.0] |
[Node[0], Node[2]] |
3 |
"A" |
"D" |
90.0 |
["A", "B", "D"] |
[0.0, 50.0, 90.0] |
[Node[0], Node[1], Node[3]] |
4 |
"A" |
"E" |
120.0 |
["A", "B", "D", "E"] |
[0.0, 50.0, 90.0, 120.0] |
[Node[0], Node[1], Node[3], Node[4]] |
5 |
"A" |
"F" |
160.0 |
["A", "B", "D", "E", "F"] |
[0.0, 50.0, 90.0, 120.0, 160.0] |
[Node[0], Node[1], Node[3], Node[4], Node[5]] |
结果显示了节点 A 与图中所有其他可达节点之间最短路径的总成本。它还显示了为找到最短路径所遍历的节点 ID 的有序列表,以及已访问节点的累计成本。这可以在示例图中进行验证。Cypher 路径对象可以通过 path 返回字段获取。路径对象包含节点对象以及具有 cost 属性的虚拟关系。
变异(Mutate)模式
mutate 执行模式会使用新关系更新命名图。每条新关系代表从源节点到目标节点的一条路径。关系类型使用 mutateRelationshipType 选项进行配置。路径总成本使用 totalCost 属性存储。
当多个算法结合使用时,mutate 模式特别有用。
有关 mutate 模式的更多详细信息,请参阅 变更。
mutate 模式运行该算法:MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.delta.mutate('myGraph', {
sourceNode: source,
relationshipWeightProperty: 'cost',
mutateRelationshipType: 'PATH'
})
YIELD relationshipsWritten
RETURN relationshipsWritten
| relationshipsWritten |
|---|
6 |
执行上述查询后,内存图将更新为类型为 PATH 的新关系。这些新关系将存储一个单一属性 totalCost。
|
即使输入图是无向的,所产生的关系也始终是有向的。 |
写入(Write)模式
write 执行模式使用新关系更新 Neo4j 数据库。每条新关系代表从源节点到目标节点的一条路径。关系类型使用 writeRelationshipType 选项进行配置。路径总成本使用 totalCost 属性存储。中间节点的 ID 使用 nodeIds 属性存储。到达中间节点的累计成本使用 costs 属性存储。
有关 write 模式的更多详细信息,请参阅 写入。
write 模式运行该算法:MATCH (source:Location {name: 'A'})
CALL gds.allShortestPaths.delta.write('myGraph', {
sourceNode: source,
relationshipWeightProperty: 'cost',
writeRelationshipType: 'PATH',
writeNodeIds: true,
writeCosts: true
})
YIELD relationshipsWritten
RETURN relationshipsWritten
| relationshipsWritten |
|---|
6 |
上述查询将把 6 个 PATH 类型的关系写回 Neo4j。这些关系存储了三个描述路径的属性:totalCost、nodeIds 和 costs。
|
即使输入图是无向的,所写入的关系也始终是有向的。 |