卷挂载和持久卷

Neo4j Helm Chart 使用卷挂载和持久卷来管理数据及其他 Neo4j 文件的存储。

卷挂载

卷挂载 (Volume mount) 是 Kubernetes Pod 规范的一部分,用于描述卷如何在容器内挂载以及挂载到何处。

Neo4j Helm Chart 创建以下卷挂载:

  • backups:挂载于 /backups

  • data:挂载于 /data

  • import:挂载于 /import

  • licenses:挂载于 /licenses

  • logs:挂载于 /logs

  • metrics:挂载于 /metrics (Neo4j 社区版不生成 metrics。)

也可以指定 plugins 卷挂载(挂载于 /plugins),但这并非由默认 Helm Chart 创建。有关更多信息,请参阅使用 plugins 卷添加插件

持久卷

PersistentVolume (PV) 是 Kubernetes 集群中的一种存储资源,其生命周期独立于使用该 PV 的任何单个 Pod。
PersistentVolumeClaim (PVC) 是用户对存储资源的请求。PVC 会消耗 PV 资源。有关 PV 是什么及其工作原理的更多信息,请参阅 Kubernetes 官方文档

所使用的 PV 类型及其配置会对 Neo4j 的性能产生重大影响。某些 PV 类型完全不适合与 Neo4j 一起使用。

用于 data 卷挂载的卷类型尤为重要。Neo4j 支持以下用于 data 卷挂载的 PV 类型:

  • persistentVolumeClaim

  • 当使用 Docker Desktop 时可使用 hostPath [1]

Neo4j data 卷挂载不支持 azureFilenfs

awsElasticBlockStoreazureDiskgcePersistentDisk 现已在 Kubernetes 中成为弃用的卷类型,Neo4j Helm Chart 不再支持使用它们。如果您当前正在使用这些卷类型之一,请参阅您的 Kubernetes 供应商文档,了解如何迁移到基于容器存储接口 (CSI) 驱动的存储。

对于除 data 卷挂载以外的其他卷挂载,通常假定所有 PV 类型均可工作。

只要使用合适的底层存储(如 SSD),hostPathlocalemptyDir 类型预计会有良好的性能。然而,这些卷类型有操作限制,不建议使用。

也不建议使用 HDD 或云存储(例如作为驱动器挂载的 AWS S3)。

将卷挂载映射到持久卷

默认情况下,Neo4j Helm Chart 使用名为 data 的单个 PV 来支持卷挂载。

可以通过修改 Helm Chart 值中的 volumes.<volume name> 对象来更改每个卷挂载所使用的卷。

Neo4j Helm Chart 的 volumes 对象支持多种模式,例如 dynamicsharedefaultStorageClassvolumeselectorvolumeClaimTemplate。您还可以为模式为 dynamicdefaultStorageClassselectorvolumeClaimTemplate 的卷在创建时设置标签,该标签可用于过滤用于卷挂载的 PV。

mode: share

描述

卷挂载共享来自其他卷对象之一的底层卷。

示例

logs 卷挂载使用 data 卷(这是默认行为)。

volumes:
  logs:
    mode: "share"
    share:
      name: "data"

mode: defaultStorageClass

描述

卷挂载由 PV 提供支持,该 PV 由 Kubernetes 使用默认的 StorageClass 动态配置。

示例

一个大小为 10Gi 的动态配置 data 卷。

volumes:
  data:
    labels:
        data: "true"
    mode: "defaultStorageClass"
    defaultStorageClass:
      requests:
        storage: 10Gi

对于 data 卷,如果未设置 requests.storagedefaultStorageClass 默认为 10Gi 卷。对于所有其他卷,当使用 defaultStorageClass 模式时,必须显式设置 defaultStorageClass.requests.storage

mode: volume

描述

可以为卷挂载指定一个完整的 Kubernetes volume 对象。通常,以这种方式指定的卷必须手动配置。

volume 可以是任何有效的 Kubernetes 卷类型。此模式通常用于挂载预先存在的持久卷声明 (PVC)。

有关如何指定 volume 对象的详细信息,请参阅 Kubernetes 文档

设置挂载卷的文件权限

Neo4j Helm Chart 支持一个在普通 Kubernetes volume 对象中不存在的额外字段:setOwnerAndGroupWritableFilePermissions: true|false。如果设置为 true,将运行一个 initContainer 来修改挂载卷的文件权限,以便 Neo4j 进程可以读写其中的内容。这是为了帮助解决某些不支持 Pod SecurityContext 设置的卷实现问题。

示例 - 引用现有的 PersistentVolume

backups 卷挂载由指定的 PVC 支持。使用此方法时,persistentVolumeClaim 对象必须已经存在。

volumes:
  backups:
    mode: volume
    volume:
      persistentVolumeClaim:
        claimName: my-neo4j-pvc

mode: selector

描述

要使用的卷是根据提供的 selector 对象和一个动态生成的 PVC 从现有的 PV 中选择的。

如果没有匹配的 PV 存在,Neo4j Pod 将无法启动。要进行匹配,PV 必须具有指定的 StorageClass,匹配 selectorTemplate 标签,并具有足够的存储容量来满足请求的存储量。

示例

data 卷是从具有 neo4j 存储类和 developer: alice 标签的可用卷中选择的。

volumes:
  import:
    labels:
        import: "true"
    mode: selector
    selector:
      storageClassName: "neo4j"
      requests:
        storage: 128Gi
      selectorTemplate:
        matchLabels:
          developer: "alice"

对于 data 卷,如果未设置 requests.storageselector 默认为 100Gi 卷。对于所有其他卷,当使用 selector 模式时,必须显式设置 selector.requests.storage

mode: volumeClaimTemplate

描述

为卷挂载指定一个完整的 Kubernetes volumeClaimTemplate 对象。以这种方式指定的卷是动态配置的。

示例 - 使用卷声明模板配置 Neo4j 存储

数据卷使用来自 default 存储类的动态配置 PVC。

volumes:
  data:
    labels:
        data: "true"
    mode: volumeClaimTemplate
    volumeClaimTemplate:
      storageClassName: "default"
      accessModes:
        - ReadWriteOnce
      resources:
        requests:
          storage: 10Gi

在任何情况下,自定义 volumes 对象时都不要忘记设置 mode 字段。如果未设置,无论 volume 对象上设置了哪些其他属性,都会使用默认的 mode

使用 Neo4j Helm Chart 配置持久卷

动态配置持久卷

使用 Neo4j Helm Chart,您可以使用默认或自定义的 StorageClass 动态配置 PV。要查看 Kubernetes 集群中可用存储类的列表,请运行以下命令:

kubectl get storageclass

使用 defaultStorageClass 配置 PV

使用运行中的 Kubernetes 集群的默认 StorageClass 是针对简单测试快速启动和运行 Neo4j(处理少量数据)的最快方法。但是,不建议用于大量数据,因为它可能会导致性能问题。

示例:使用 defaultStorageClass 部署 Neo4j

以下示例展示了如何部署带有使用默认 StorageClass 的动态配置 PV 的 Neo4j 服务器。

  1. 创建一个 default-storage-class-values.yaml 文件,将数据卷配置为使用默认 StorageClass100Gi 的存储大小

    storage-class-values.yaml
    volumes:
      data:
        mode: "defaultStorageClass"
        defaultStorageClass:
          requests:
            storage: 100Gi
  2. 安装单个 Neo4j 服务器

    helm install standalone-with-default-storage-class neo4j -f default-storage-class-values.yaml

手动配置持久卷

可选地,Helm Chart 可以为 Neo4j 存储使用手动创建的磁盘。与使用动态卷相比,此安装选项步骤更多,但它确实提供了对磁盘如何配置的更多控制。

手动配置 PV 的说明因所使用的 PV 类型和底层基础设施而异。通常有两个步骤:

  1. 在底层基础设施中创建要用于存储的磁盘/卷。例如:

    • 如果使用 csi 卷 — 使用云提供商 CLI 或控制台创建持久磁盘。

    • 如果使用 hostPath 卷 — 在宿主机节点上创建路径(目录)。

  2. 在 Kubernetes 中创建一个引用步骤 1 中创建的底层资源的 PV。

    1. 确保创建的 PV 的 app 标签与 Neo4j Helm 发行版的名称相匹配。

    2. 确保创建的 PV 的 capacity.storage 与底层基础设施上可用的存储相匹配。

如果没有合适的 PV 或 PVC 存在,Neo4j Pod 将无法启动。

Neo4j StatefulSet 可以根据其标签选择要使用的持久卷。Neo4j Helm 发行版仅使用满足以下条件的已手动配置的 PV:

  • storageClassName 使用 provisioner kubernetes.io/no-provisioner

  • 一个 app 标签 — 设置在它们的元数据中,与 Helm 安装的 neo4j.name 值相匹配。

  • 足够的存储容量 — PV 容量必须大于或等于为 Neo4j Helm 发行版设置的 volumes.data.selector.requests.storage 值(默认值为 100Gi)。

neo4j/neo4j-persistent-volume Helm Chart 提供了一种配置持久卷的便捷方法。

示例:使用选择器卷部署 Neo4j

以下示例展示了如何使用选择器卷部署 Neo4j。

  1. 创建一个 persistent-volume-selector.yaml 文件,将数据卷配置为使用选择器

    storage-class-values.yaml
    neo4j:
      name: volume-selector
    volumes:
      data:
        mode: selector
        selector:
          storageClassName: "manual"
          accessModes:
            - ReadWriteOnce
          requests:
            storage: 10Gi
  2. 导出命令要使用的环境变量

    export RELEASE_NAME=volume-selector
    export GCP_ZONE="$(gcloud config get compute/zone)"
    export GCP_PROJECT="$(gcloud config get project)"
  3. 创建持久卷要使用的磁盘

    gcloud compute disks create --size 10Gi --type pd-ssd "${RELEASE_NAME}"
  4. 使用 neo4j/neo4j-persistent-volume Chart 配置持久卷。此命令将创建一个持久卷和一个使用 kubernetes.io/no-provisioner 提供器的手动存储类。

    helm install "${RELEASE_NAME}"-disk neo4j/neo4j-persistent-volume \
           --set neo4j.name="${RELEASE_NAME}" \
           --set data.driver=pd.csi.storage.gke.io \
           --set data.storageClassName="manual" \
           --set data.reclaimPolicy="Delete" \
           --set data.createPvc=false \
           --set data.createStorageClass=true \
           --set data.volumeHandle="projects/${GCP_PROJECT}/zones/${GCP_ZONE}/disks/${RELEASE_NAME}" \
           --set data.capacity.storage=10Gi
  5. 现在使用之前创建的 persistent-volume-selector.yaml 安装 Neo4j

    helm install "${RELEASE_NAME}" neo4j/neo4j -f persistent-volume-selector.yaml
  6. 清理 Helm 安装和为示例创建的磁盘

    helm uninstall ${RELEASE_NAME} ${RELEASE_NAME}-disk
    kubectl delete pvc data-${RELEASE_NAME}-0
    gcloud compute disks delete ${RELEASE_NAME} --quiet

在 EKS 集群中配置 EBS 磁盘需要 EBS CSI 驱动插件。您可以运行命令 kubectl get daemonset ebs-csi-node -n kube-system 来检查是否已安装。有关安装驱动程序的说明,请参阅 AWS 文档

  1. 创建一个 persistent-volume-selector.yaml 文件,将数据卷配置为使用选择器

    storage-class-values.yaml
    neo4j:
      name: volume-selector
    volumes:
      data:
        mode: selector
        selector:
          storageClassName: "manual"
          accessModes:
            - ReadWriteOnce
          requests:
            storage: 10Gi
  2. 导出命令要使用的环境变量

    readonly RELEASE_NAME=volume-selector
    readonly AWS_ZONE={availability zone of EKS cluster}
  3. 创建持久卷要使用的磁盘

    export volumeId=$(aws ec2 create-volume \
                        --availability-zone="${AWS_ZONE}" \
                        --size=10 \
                        --volume-type=gp3 \
                        --tag-specifications 'ResourceType=volume,Tags=[{Key=volume,Value='"${RELEASE_NAME}"'}]' \
                        --no-cli-pager \
                        --output text \
                        --query VolumeId)
  4. 使用 neo4j/neo4j-persistent-volume Chart 配置持久卷。此命令将创建一个持久卷和一个使用 kubernetes.io/no-provisioner 提供器的手动存储类。

    helm install "${RELEASE_NAME}"-disk neo4j-persistent-volume \
        --set neo4j.name="${RELEASE_NAME}" \
        --set data.driver=ebs.csi.aws.com \
        --set data.reclaimPolicy="Delete" \
        --set data.createPvc=false \
        --set data.createStorageClass=true \
        --set data.volumeHandle="${volumeId}" \
        --set data.capacity.storage=10Gi
  5. 现在使用之前创建的 persistent-volume-selector.yaml 安装 Neo4j

    helm install "${RELEASE_NAME}" neo4j/neo4j -f persistent-volume-selector.yaml
  6. 清理 Helm 安装和为示例创建的磁盘

    helm uninstall ${RELEASE_NAME} ${RELEASE_NAME}-disk
        kubectl delete pvc data-${RELEASE_NAME}-0
        aws ec2 delete-volume --volume-id ${volumeId}
  1. 创建一个 persistent-volume-selector.yaml 文件,将数据卷配置为使用选择器

    storage-class-values.yaml
    neo4j:
      name: volume-selector
    volumes:
      data:
        mode: selector
        selector:
          storageClassName: "manual"
          accessModes:
            - ReadWriteOnce
          requests:
            storage: 10Gi
  2. 导出命令要使用的环境变量

    readonly AKS_CLUSTER_NAME={AKS Cluster name}
    readonly AZ_RESOURCE_GROUP={Resource group of cluster}
    readonly AZ_LOCATION={Location of cluster}
  3. 创建持久卷要使用的磁盘

    export node_resource_group=$(az aks show --resource-group "${AZ_RESOURCE_GROUP}" --name "${AKS_CLUSTER_NAME}" --query nodeResourceGroup -o tsv)
    export disk_id=$(az disk create --name "${RELEASE_NAME}" --size-gb "10" --max-shares 1 --resource-group "${node_resource_group}" --location ${AZ_LOCATION} --output tsv --query id)
  4. 使用 neo4j/neo4j-persistent-volume Chart 配置持久卷。此命令将创建一个持久卷和一个使用 kubernetes.io/no-provisioner 提供器的手动存储类。

    helm install "${RELEASE_NAME}"-disk neo4j-persistent-volume \
        --set neo4j.name="${RELEASE_NAME}" \
        --set data.driver=disk.csi.azure.com \
        --set data.storageClassName="manual" \
        --set data.reclaimPolicy="Delete" \
        --set data.createPvc=false \
        --set data.createStorageClass=true \
        --set data.volumeHandle="${disk_id}" \
        --set data.capacity.storage=10Gi
  5. 现在使用之前创建的 persistent-volume-selector.yaml 安装 Neo4j

    helm install "${RELEASE_NAME}" neo4j/neo4j -f persistent-volume-selector.yaml
  6. 清理 Helm 安装和为示例创建的磁盘

    helm uninstall ${RELEASE_NAME} ${RELEASE_NAME}-disk
    kubectl delete pvc data-${RELEASE_NAME}-0
    az disk delete --name ${RELEASE_NAME} -y

为 Neo4j 存储配置 PVC

手动配置的另一种方法是使用手动配置的 PVC。Neo4j Helm Chart 通过使用 volume 模式支持这一点。

neo4j/neo4j-persistent-volume Helm Chart 可用于为手动配置的磁盘创建 PV 和 PVC。完整示例可在 Neo4j GitHub 仓库 中找到。例如,要使用名为 my-neo4j-pvc 的预先存在的 PVC,请设置这些值:

volumes:
  data:
    mode: "volume"
    volume:
      persistentVolumeClaim:
        claimName: my-neo4j-pvc

重用持久卷

卸载 Neo4j Helm Chart 后,PVC 和 PV 都会保留,并可被 Helm Chart 的新安装重用。如果您删除 PVC,PV 将进入 Released 状态且无法再重用。

要使 PV 能被 Neo4j Helm Chart 的新安装重用,请移除其与先前 PVC 的连接:

  1. 运行以下命令编辑 PV

    kubectl edit pv <pv-name>
  2. 移除 spec.claimRef 部分。
    PV 将回到 Available 状态,并可被 Neo4j Helm Chart 的新安装重用。

Neo4j 的性能在很大程度上取决于其所使用存储的延迟、IOPS 容量和吞吐量。为获得 Neo4j 的最佳性能,请使用可用的最佳磁盘(如 SSD),并将 IOPS 节流/配额设置为高值。对于某些云提供商,IOPS 节流与卷的大小成正比。在这种情况下,最佳性能是通过根据期望的 IOPS 而不是数据存储所需量来设置卷大小来实现的。


1. 由于 Docker Desktop 处理 hostPath 卷存在不一致,因此不建议使用。