加载 GEXF (图交换 XML 格式)

许多现有应用程序和数据集成使用 GEXF 来描述带有节点和边的图。如需了解更多信息，请访问官方文档。

可以通过 apoc.load.gexf 和 apoc.import.gexf 过程从 GEXF 文件加载或导入节点和关系。您需要：

提供 GEXF 文件的路径
提供配置（可选）

apoc.import.gexf 的读取方式与 apoc.load.gexf 相同，但它还会在 Neo4j 中创建节点和关系。

要从文件读取，您必须启用配置选项

apoc.import.file.enabled=true

默认情况下，文件路径是全局的，若要设置相对于 import 目录的路径，请设置

apoc.import.file.use_neo4j_config=true

apoc.load.gexf 示例

load.gexf

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<gexf version="1.2">
  <graph defaultedgetype="directed">
    <nodes>
      <node foo="bar">
        <attvalues>
          <attvalue for="0" value="http://gephi.org"/>
        </attvalues>
      </node>
    </nodes>
  </graph>
</gexf>

CALL apoc.load.gexf('load.gexf')

表 1. 结果
值
{_type: gexf, _children: [{_type: graph, defaultedgetype: directed, _children: [{_type: nodes, _children: [{_type: node, _children: [{_type: attvalues, _children: [{_type: attvalue, for: 0, value: http://gephi.org}]}], foo: bar}]}]}], version: 1.2}

apoc.import.gexf 示例

除了文件之外，您还可以传入一个配置映射 (config map)

表 2. 配置参数
名称 (name)	type	默认	description（描述）
readLabels	布尔值	false	根据 `node` 元素中 `labels` 属性的值创建节点标签
defaultRelationshipType	字符串	RELATED	如果 GraphML 文件中未指定关系类型，则使用的默认关系类型
storeNodeIds	布尔值	false	存储 `node` 元素的 `id` 属性
batchSize	整数	20000	每个事务处理的元素数量
compression	`枚举 [NONE, BYTES, GZIP, BZIP2, DEFLATE, BLOCK_LZ4, FRAMED_SNAPPY]`	`null`	允许接收二进制数据，可以是未压缩的（值：`NONE`）或压缩的（其他值）
source	Map<String,String>	空映射	请参阅下方的 `source / target config` 参数
target（目标）	Map<String,String>	空映射	请参阅下方的 `source / target config` 参数，参见二进制文件示例

通过以下文件将创建：

1 个带有 Gephi 标签的节点
2 个带有 Webatlas 标签的节点
1 个带有 RTGI 标签的节点
1 个带有 BarabasiLab 标签的节点
6 个类型为 KNOWS 的关系
1 个类型为 HAS_TICKET 的关系
1 个类型为 BAZ 的关系

data.gexf

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<gexf xmlns="http://gexf.net/1.3" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xsi:schemaLocation="http://gexf.net/1.3 http://gexf.net/1.3/gexf.xsd" version="1.2">
  <meta lastmodifieddate="2009-03-20">
    <creator>Gephi.org</creator>
    <description>A Web network</description>
  </meta>
  <graph defaultedgetype="directed">
    <attributes class="node">
      <attribute id="0" title="url" type="string"/>
      <attribute id="room" title="room" type="integer"/>
      <attribute id="projects" title="projects" type="long"/>
      <attribute id="price" title="price" type="double"/>
      <attribute id="1" title="indegree" type="float"/>
      <attribute id="members" title="members" type="liststring"/>
      <attribute id="pins" title="pins" type="listboolean"/>
      <attribute id="2" title="frog" type="boolean">
        <default>true</default>
      </attribute>
    </attributes>
    <attributes class="edge">
      <attribute id="score" title="score" type="float"/>
    </attributes>
    <nodes>
      <node id="0" label="Gephi">
        <attvalues>
          <attvalue for="0" value="http://gephi.org"/>
          <attvalue for="1" value="1"/>
          <attvalue for="room" value="10"/>
          <attvalue for="price" value="10.02"/>
          <attvalue for="projects" value="300"/>
          <attvalue for="members" value="[Altomare, Sterpeto, Lino]"/>
          <attvalue for="pins" value="[true, false, true, false]"/>
        </attvalues>
      </node>
       <node id="5" label="Gephi">
          <attvalues>
            <attvalue for="0" value="http://test.gephi.org"/>
            <attvalue for="1" value="2"/>
          </attvalues>
        </node>
      <node id="1" label="Webatlas">
        <attvalues>
          <attvalue for="0" value="http://webatlas.fr"/>
          <attvalue for="1" value="2"/>
        </attvalues>
      </node>
      <node id="2" label="RTGI">
        <attvalues>
          <attvalue for="0" value="http://rtgi.fr"/>
          <attvalue for="1" value="1"/>
        </attvalues>
      </node>
      <node id="3" label=":BarabasiLab:Webatlas">
        <attvalues>
          <attvalue for="0" value="http://barabasilab.com"/>
          <attvalue for="1" value="1"/>
          <attvalue for="2" value="false"/>
        </attvalues>
      </node>
    </nodes>
    <edges>
      <edge source="0" target="1" kind="KNOWS">
          <attvalues>
            <attvalue for="score" value="1.5"/>
          </attvalues>
      </edge>
      <edge source="0" target="0" kind="BAZ">
          <attvalues>
            <attvalue for="foo" value="bar"/>
            <attvalue for="score" value="2"/>
          </attvalues>
      </edge>
      <edge source="0" target="2" kind="HAS_TICKET">
          <attvalues>
            <attvalue for="ajeje" value="brazorf"/>
            <attvalue for="score" value="3"/>
          </attvalues>
      </edge>
      <edge source="0" target="2" kind="KNOWS" />
      <edge source="1" target="0" kind="KNOWS" />
      <edge source="2" target="1" kind="KNOWS" />
      <edge source="0" target="3" kind="KNOWS" />
      <edge source="5" target="3" kind="KNOWS" />
    </edges>
  </graph>
</gexf>

CALL apoc.import.gexf('data.gexf', {readLabels:true})

表 3. 结果
值
{ "relationships" : 8, "batches" : 0, "file" : "file:/../data.gexf", "nodes" : 5, "format" : "gexf", "source" : "file", "time" : 9736, "rows" : 0, "batchSize" : -1, "done" : true, "properties" : 21 }

我们还可以通过执行以下操作来存储节点 ID

CALL apoc.import.gexf('data.gexf', {readLabels:true, storeNodeIds: true})

source / target config

允许在源节点和/或目标节点不在文件中时导入关系，通过自定义标签和属性搜索节点。为此，我们可以在配置映射中插入 source: {label: '<MY_SOURCE_LABEL>', id: ’<MY_SOURCE_ID>'}` 和/或 source: {label: '<MY_TARGET_LABEL>', id: ’<MY_TARGET_ID>'}`。通过这种方式，我们可以通过 edge 标签的 source 和 target 属性来搜索开始节点和结束节点。

例如，使用配置映射 {source: {id: 'myId', label: 'Foo'}, target: {id: 'other', label: 'Bar'}}，对于类似 <edge id="e0" source="n0" target="n1" label="KNOWS"><data key="label">KNOWS</data></edge> 的边行，我们搜索源节点 (:Foo {myId: 'n0'}) 和结束节点 (:Bar {other: 'n1'})。id 键是可选的（默认值为 'id'）。